（１）执行标准不同：国家质量技术监督法律规定，生产复混肥执行的标准是《复混肥料》强制性国家标准。而生产复合肥执行的都是由生产企业起草完成后送省级质量技术监督局备案的企业标准。

（２）生产工艺不同：复混肥的生产工艺比较简单，通常是将尿素、过磷酸钙、氯化钾通过机械混匀加工，一般不需要利用昂贵化学生产设备。而复合肥却是生产过程中利用化学反应制成的，完成这一过程需要复杂的技术和价值昂贵的化工设备。

（３）监督管理形式不同：由于生产复混肥一般无须昂贵的化工设备，以次充好，以假充真相对容易。为保护农民的利益，国家质量技术监督部门实行《工业产品生产许可证》监督管理。而复合肥生产无须此证。